循環冷卻水體中細菌主要有異養菌、自養菌、霉菌、酵母菌等。即以有機物為碳源的細菌都稱為異養菌，自養菌是以二氧化碳，碳酸鹽作為碳源的細菌。霉菌、酵母菌是不能進行光合作用的真核生物。菌類主要危害表現在產生粘泥沉積覆蓋在換熱器中換熱管及相關流體管壁，降低冷卻水冷卻作用，增加運行成本。真菌對金屬并沒有直接的腐蝕性，但它產生的粘狀沉積物會在金屬表面建立差異腐蝕電池而引起金屬的腐蝕，并且粘狀沉積物覆蓋在金屬表面，加快金屬的點腐蝕而形成銹垢。

     藻類對循環水體的危害在于死亡的藻類會變成冷卻水系統中懸浮物和沉積物。在換熱器中，為細菌和霉菌提供食物。藻類形成的團塊進入換熱器中后，會堵塞換熱器中的管路，降低冷卻水的流量，從而降低冷卻水的冷卻效果。生成的沉積物所覆蓋的金屬表面則由于形成差異腐蝕電池而常會發生垢下腐蝕。

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